印度尼西亚华人现在已成为印度尼西亚民族大家雇中的一员，虽然其人数不及印度尼西亚最大的几个民族如爪哇族和粪达族，但却比大多数其他民族人口要多，尽管其在印度尼西亚总人口中所占的比例不大，但在印度尼西亚社会生活中的影响却不小。

据史书记载，自公元1世纪前后起就有华人陆续到印度尼西亚定居，唐代时定居的人数多了起来，公元924年，即中国历史上后唐同光二年，有一艘中国货轮在印度尼西亚的三宝垅附近沉没，船上人员将所载宝物献于当地的直葛王，得王之允许，便在当地定居下来，并受到优待，因此可以说华人在印度尼西亚形成规模的定居已有上千年的历史。其后在公元1294年，中国元朝皇帝元世祖忽必烈派出的远征军在撤出爪哇时，有一部分掉队和伤残的士卒留在了印度尼西亚，成为早期定居在印度尼西亚的华人，其中包括蒙古族人，到公元1445年，定居印度尼西亚的华人已为数不少，初步形成了华人社会，据当年随同郑和前往爪哇的马欢记载，他们曾到过一个华人村，人口约有千余人。

中国人大量移居印度尼西亚是在荷兰人对印度尼西亚实行殖民统治之后开始的，荷兰殖民者为了加紧掠夺印度尼西亚的自然资源，利用中国的廉价劳动力开辟种植园和开发矿山，便从中国广东和福建拐骗大量劳动人民去印度尼西亚当劳工，1888一1931年，仅棉兰地区，被荷兰殖民者从中国运来的苦工就达35.6万人，自那时起至新中国成立之前，受中国国内战乱和自然灾害影响，广东和福建沿海又有大批居民陆续流向南洋，其中不少人到了印度尼西亚，使印度尼西亚华人的数量不断增长。印度尼西亚官方未公布过确切的印度尼西亚华人人数，说华人占印度尼西亚总人口4%，人口800万，这只是个估计数，如果以800万而言，印尼华人在全国人口中所占的比例虽远不如新加坡、马来西亚、泰国等国华人的比例，但就人数而言，印度尼西亚是世界上华人人数最多的国家，在这800万印度尼西亚华人中，97%以上已加人印度尼西亚国籍，成为印尼公民，在中国与印度尼西亚于1990年恢复外交关系之前，印度尼西亚尚有数量较多的华侨，并有一些无国籍华人，两国复交后，根据两国政府的协议，对这部分人的国籍重新进行了登记，经过这次重新登记，继续保留中国国籍的华人已只占印度尼西亚华人的极小比例，他们绝大多数为60岁以上老人，不愿再改变国籍，估计20年之后，印度尼西亚就不再有原来意义上的华侨了。

在华人定居印度尼西亚的漫长岁月中，华人与原住民早已有通婚关系，产生了一代又一代的华一印度尼西亚混血种人，在爪哇的梭罗和井里坟以及南苏门答腊的巨港，历史上当地的王朝曾与中国的王室有联姻关系，这些王宫的后裔中不少人身上有着中国血统，不过有中国血统的混血种人，已经不懂汉语，文化习俗上也都已经印尼化，政府已将他们看作是原住民，不计人华人之列。